براساس ارزشيابي وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشكي دانشگاه علوم پزشكي تهران با دارا بودن 32 مركز تحقيقاتي، هشت قطب علمي و دو مركز رشد ( مركز رشد علوم دارويي و مركز رشد تجهيزات پزشكي ) رتبه نخست پژوهشي را در سه سال پياپي كسب كرده است .
به گزارش سرويس «پژوهشي» خبرگزاري دانشجويان ايران (ايسنا) واحد علوم پزشكي تهران، اين دانشگاه با دارا بودن هشت قطب علمي شامل قطب علمي تحقيقات غدد و متابوليسم، قطب علمي تحقيقات هماتولوژي، آنكولوژي و پيوند مغز استخوان، قطب علمي تحقيقات گوارش، قطب علمي روماتولوژي، قطب علمي انستيتو تحقيقات بهداشتي، قطب علمي انستيتو سرطان، قطب علمي سم شناسي و مواد خوراكي و قطب علمي شيمي دارويي جايگاه ويژه اي را در پژوهش‌هاي پزشكي كشور كسب كرده است.
برنامه ريزي استراتژيك دانشگاه، پتانسيل هاي دانشگاه و مديريت موثر از طريق به كارگيري راهبردها كه شامل پايش و ارزشيابي، بسيج منابع و امكانات، بستر سازي از طريق ترويج و تبليغ، ايجاد امكان براي بروز خلاقيت‌ها، مشاركت دادن جامعه، استفاده از پژوهش در تصميم گيري ها، ايجاد شبكه و كارگروهي و تعيين اولويت هاي پژوهش مي‌باشد، از جمله زمينه‌هاي تحقق اين امر عنوان شده است.