رييس دانشگاه آزاد اسلامي قزوين، گفت: هر دانشگاه و سازماني ممکن است دعواي حقوقي با نهاد و يا شخصي داشته باشد، اما اين اختلافات را نبايد به صحنه‌ دانشگاه کشاند، چراکه اين کار منطقي نيست. 
مرتضي موسي‌خاني، اظهار كرد: جنجال به پا کردن براي رسيدگي به آنچه از نظر ما درست نيست، کار صحيحي نيست، زيرا ما در کشور داراي دستگاه‌هاي نظارتي هستيم.
وي با بيان اينكه نظام ما نظامي ارزشي است و آبروي آن بسيار مهم است، گفت: نبايد کاري کنيم که دشمن از آن سواستفاده کند، امروز همه بر روي جمهوري اسلامي ايران به عنوان الگوي موفق تمرکز کرده‌اند.
موسي‌خاني با بيان اينكه مقام معظم رهبري همه ما را به نقد منصفانه و کارشناسانه تشويق کرده‌اند و چند بار تأکيد کردند که از تخريب دوري کنيم، اعلام کرد: البته ممکن است من از عملکرد کارکنان اداره‌هاي شهر و مسئولان خرده داشته باشم، اما اينها نقد فردي و شخصي است و نمي‌تواند نظرات صحيحي باشد.
رئيس دانشگاه آزاد قزوين با اشاره به تاريخچه تأسيس دانشگاه آزاد اسلامي، تصريح کرد: دانشگاه آزاد اسلامي دانشگاهي است که پسوند اسلامي دارد و با حمايت امام خميني (ره) تأسيس شده است و منتقدان اين دانشگاه بايد ضمن رعايت انصاف طوري صحبت نکنند که موجب سو استفاده دشمنان شود.
رييس دانشگاه آزاد قزوين تصريح کرد: امروز نيز دولت با قدرت، شبانه‌روز خدمت مي‌کند و حال اگر کسي در اين ميان اشتباهي کرد، نبايد دولت را زير سئوال ببريم، چرا که در کشور قانون وجود دارد و دستگاه‌هاي نظارتي چون ديوان محاسبات، قوه قضائيه و غيره بايد به اينگونه مسائل رسيدگي کنند.
بايد فرهيختگي را به دانشجويان القا کنيم
وي در ادامه در خصوص نسبت دادن برخي ناهنجاري‌هاي فرهنگي به دانشگاه آزاد، گفت: مشکلات فرهنگي به دانشگاه ارتباطي ندارد، چرا که سياست‌گذاري شهر بر عهده ديگران است و اين دانشجويان فقط در دانشگاه حضور ندارند بلکه محصول خانواده‌ها، صدا و سيما و آموزش و پرورش نيز هستند